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A apresentação destaca a natureza interdependente das exigências de produção de conhecimento e de tomada de decisões relacionadas com a prevenção de doenças emergentes no atual contexto brasileiro. Com referências na produção científica e evidências contextuais, verificam-se situações relacionadas com a Amazônia, que sofre perturbações sistemáticas e é caracterizada como um notável repositório de microrganismos potencialmente patogênicos aos seres humanos. Na aceleração das mudanças ambientais do Antropoceno, instabilidades sócio-ecológicas e a possibilidade do surgimento de doenças infecciosas fundem-se como pano de fundo de uma "insurgência dupla". Neste contexto, há uma tendência para prevalecer a hegemonia econômica no desenvolvimento brasileiro, corroborando discursos e pressões para simplificação e negação científica. Com isto, afirmamos que as ações setoriais de desenvolvimento e a monocultura do conhecimento caracterizam uma agenda de omissão, ou seja, um processo de tomada de decisão que corrobora a degradação ecológica e o descuido perante a possibilidade do aparecimento e propagação de novas doenças, como a COVID-19. Fazer face à complexidade sócio-ecológica inerente ao risco do surgimento de doenças infecciosas demanda sólida co-construção do conhecimento, abordagens ecossociais, correspondente governança e sofisticados mecanismos de tomada de decisão.